Situato sul massiccio del Monte Rosa, il ghiacciaio del Lys inizia al Colle del Lys (4248 metri) e scende fino a quota 2600 metri nell’alta Valle del Lys. È tra i ghiacciai più ampi della Valle d’Aosta ed è anche fra i più grandi del versante meridionale alpino con 3920 metri quadrati di estensione all’ultima rilevazione.
È contornato dalle vette dei Lyskamm, del Balmenhorn, della Ludwigshöhe e della Piramide Vincent.
Esposto a sud, soffre la radiazione solare: infatti è molto meno esteso rispetto al grande ghiacciaio del Grenz che scende sul versante svizzero a nord.
Sui suoi bordi sorgono i rifugi: rifugio città di Mantova, capanna Giovanni Gnifetti (3647 metri), bivacco Felice Giordano (4167 metri) e rifugio Quintino Sella al Felik (3585 metri).
Dal ghiacciaio deriva il torrente Lys che solca la vallata omonima fino a Pont-Saint-Martin dove il corso d’acqua si immette nella Dora Baltea.